Судебная система состоит из федеральных и провинциальных судов.

Федеральные суды включают Верховный суд правосудия, 17 апелляционных судов, окружные и территориальные суды на местах. Провинциальные системы, организованные по образцу федеральной, включают верховные, апелляционные и нижестоящие суды.

Федеральный Верховный суд состоит из 9 судей, назначаемых Президентом с согласия Сената. Таким же образом назначаются другие федеральные судьи. Судьи Верхового и нижестоящих судов сохраняют должности, пока ведут себя безупречно. По достижении судьями возраста 75 лет необходимо их новое назначение в вышеуказанном порядке (на 5-летний срок).

Верховный суд осуществляет свою юрисдикцию как апелляционный (за исключениями, предусмотренными Конституцией). Единственной и окончательной инстанцией он служит в делах, касающихся иностранных послов, посланников и консулов, в делах, где стороной является какая-либо провинция, и т.д.

Обязанность выбора судей и управление судебной властью лежат на Совете судей. Совет образуется периодически таким образом, чтобы сохранялось равновесие между представительством политических органов, избранных в результате всенародных выборов, судей всех инстанций и адвокатов из федерального списка. В него входят также представители академической и научной среды, число которых предусматривает закон.

Совет судей вправе: выбирать посредством публичных конкурсов соискателей в магистратуру низшей инстанции; высказывать предложения, связанные с тремя кандидатами для назначения судей низших судов; управлять ресурсами и выполнять бюджет, которые закон ассигнует на управление правосудием; осуществлять дисциплинарные взыскания судей; решать вопрос о начале процедуры отстранения судей, сформулировав соответствующее обвинение.

В Аргентине нет специального органа конституционного контроля; соответствующую функцию выполняют суды общей юрисдикции всех уровней. Верховный суд имеет право объявить любой законодательный акт антиконституционным.

Прокуратура является независимым органом с функциональной и финансовой автономией.

Статья 86 Конституции Аргентины предусматривает должность, аналогичную должности омбудсмана. Защитник народа – независимый орган, учрежденный внутри Конгресса страны, который действует с полной функциональной автономией без получения инструкций от какой-либо власти. Его задача- защита и охрана прав человека и остальных прав, гарантий и интересов, защищаемых Конституцией. Защитник народа назначается и отстраняется от должности Конгрессом 2/3 голосов присутствующих членов каждой из палат. Он пребывает на своей должности 5 лет и может быть назначен снова только один раз.

Высшим органом финансово-экономического контроля в Аргентине является Генеральная палата аудита (Auditoria General), осуществляющая свои полномочия от имени и в порядке "технического содействия" законодательной власти. Председатель палаты назначается по предложению политической партии оппозиции с наибольшим числом представителей в Конгрессе. В ведении Генеральной палаты аудита находится контроль за законностью всей деятельности централизованного и децентрализованного государственного управления. При необходимости она вмешивается в процедуру одобрения или отказа от представляемых счетов и инвестиций государственных фондов.